| ||||| ANGD ЯÉCIPROCS : 14-16 septembre 2011, Aussois |
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Installations des programmes
A fin de ne pas perdre de temps sur place, les participants à la formation sont invités à télécharger et installer les programmes suivants sur leur ordinateur portable :
[7ZIP] -
[CFGUI] -
[CRYSTALS] -
[EDMA] -
[FOX] -
[JANA] -
[JAVA] -
[MERCURY] -
[MOPRO] -
[NOTEPAD++] -
[OLEX2] -
[OPENBABEL] -
[PLATON] -
[SHELX] -
[SUPERFLIP] -
[VESTA] -
[WINGX] -
MOPRO (Affinement structural à l'échelle atomique et subatomique)
| Site | http://www.crystallography.fr/crm2/fr/labo/equipes/emqc/mopro.html |
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| Téléchargement | http://www.crystallography.fr/crm2/fr/labo/equipes/emqc/mopro-download.html | ||
| Exemple de données | gz_trf.zip | ||
| Tutorial "MOPRO database transfert" (A. van der Lee) |
MOPRO_database_transfer_tutorial_AvdL.pdf |
FOX (Détermination structurale à haute et moyenne résolution pour poudres et mono-cristaux)
| Site | http://vincefn.net/Fox/ |
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| Téléchargement | http://vincefn.net/Fox/Download |
OpenBabel (Outil de conversion)
| Site | http://openbabel.org/wiki/Main_Page |
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| Téléchargement | http://openbabel.org/wiki/Get_Open_Babel |
JANA2006 (Affinement de structures "normales" et modulées)
| Site | http://jana.fzu.cz/ |
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| Téléchargement | http://jana.fzu.cz/#download |
Superflip et EDMA ("Charge Flipping")
| Site | http://superflip.fzu.cz/ |
Il est à noter que ces deux programmes sont inclus dans les dernières distributions de WinGX et CRYSTALS, bien qu'il y ait un décalage entre la dernière version de Superflip et celle dans les distributions.
Interfaces pour Superflip et EDMA
| CFGUI | http://vdlee.free.fr/cfgui/cfgui.html |
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| OLEX2 | http://www.olex2.org/ |
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| CRYSTALS | http://www.xtl.ox.ac.uk/crystals.1.html |
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| WinGX | http://www.chem.gla.ac.uk/~louis/software/wingx/ |
PLATON (Boite à outils cristallographique)
| Site | http://www.chem.gla.ac.uk/~louis/software/platon/ |
VESTA (Visualisation de structures)
| Site | http://www.geocities.jp/kmo_mma/crystal/en/vesta.html |
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| Téléchargement | http://www.geocities.jp/kmo_mma/crystal/en/download-vesta.html |
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| Remarque | Pour interfacer VESTA avec JANA, il faut, dans JANA, aller dans la rubrique "Tools --> Programs / Graphics viewer" et définir
le chemin d'accès de VESTA.exe. Il est également possible de procéder de la même manière pour "3d visualization of maps". |
SHELXL (Affinement de structures "normales")
| Site | http://shelx.uni-ac.gwdg.de/SHELX/ |
Utilitaires
| Compacteur 7-Zip | http://www.7-zip.org/ |
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| Editeur Notepad++ | http://notepad-plus-plus.org/fr/ |
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| Java | http://java.sun.com/javase/downloads/index.jsp |