||||| ANF ЯÉCIPROCS : 13-15 juin 2012, Carquairanne | ||||| |
Installations des programmes
A fin de ne pas perdre de temps sur place, les participants à la formation sont invités à télécharger et installerles programmes suivants sur leur ordinateur portable :
[7ZIP] -[FULLPROF] -[JANA] -[MEM] -[NOTEPAD++] -[PDF] -[PyMOL] -[VESTA] -
Fonction de Distribution de Paires
Le programme PDFGetX2 de calcul de la DPF à partir d'un diagramme de poudre rayons X étant une application créée sous IDL, il estnécessaire et indispensable d'installer cette machine virtuelle pour pouvoir l'éxécuter. L'installation des programmes de traitementde la PDF se fait en trois étapes distinctes :
PDFGui (simulation et affinement) | diffpy-1.0-r3067.exe Remarque : Éxécuter diffpy-1.0-r3067.exe et installer le programme dans un répertoire particulier (ex : c:\progs\diffpy) | ||
IDL (machine virtuelle) | idl62win.exe Remarque : Éxécuter idl62win.exe et installer "IDL Virtual Machine" seulement. | ||
PDFGetX2 (calcul de la DPF à partir d'un diagramme de poudre rayons X) | pdfgetx2-1.0-050315-win.exe Remarque : Éxécuter pdfgetx2-1.0-050315-win.exe et installer le programme dans un répertoire particulier (ex : c:\progs\pdfgetx2) | ||
Exercices | pdf-exo.zip |
Pour tout problème, contacter directement Pierre Bordet
Maximum d'Entropie (BayMEM)
BayMEM | Programme : BayMEM.exe Documentation : BayMEM_manual.pdf Remarque : Installer le programme dans un répertoire particulier (ex : c:\progs\MEM) | ||
PRIOR | Programme : prior.exe Documentation : prior_manual.pdf Remarque : Installer le programme dans un répertoire particulier (ex : c:\progs\MEM) | ||
EDITM81 | editm81.exe Remarque : Installer le programme dans un répertoire particulier (ex : c:\progs\MEM) | ||
Table | factors_atomsions.fit Remarques : Installer le fichier dans un répertoire particulier (ex : c:\progs\MEM) et définir la variable d'environnement PRIORDATA avec la valeur c:\progs\MEM\factors_atomsions.fit | ||
Exercices | TP_MEM_data.zip | ||
Jana2006 | Jana | ||
Vesta | Vesta |
PyMOL Visualisation graphique de structures crisstalines)
Site de PyMOL | http://www.pymol.org/ | ||
PyMOL pour Windows | http://www.ibgc.cnrs.fr/filez/mu1h Remarque : Sauvegarder le fichier téléchargé dans un répertoire temporaire (ex: c:\temp) et exécuter le programme d'installation : PyMOL sera installé dans le répertoire c:\program files\PYMOL) | ||
PyMOL pour Mac | http://www.ibgc.cnrs.fr/filez/t6nx79 | ||
Documentation | PymolRef.pdf |
FULLPROF (Affinement structural sur poudres (Rietveld)
Site | http://www.ill.eu/sites/fullprof/ | ||
Téléchargement | http://www.ill.eu/sites/fullprof/downloads/Setup_FullProf_Suite_May2012.exe | ||
Exercice PbSO4 | PbSO4_exo.zip |
JANA2006 (Affinement de structures "normales" et modulées)
Site | http://jana.fzu.cz/ | ||
Téléchargement | http://www-xray.fzu.cz/jana/download/stable2006/janainst.msi Remarque : Éxécuter le programme janainst.msi et installer le programme dans un répertoire particulier (ex : c:\progs\jana2006) | ||
Exercice AgSbS | AgSbS_aharmonic_Cookbook_Jana2006.zip |
VESTA (Visualisation de structures)
Site | http://jp-minerals.org/vesta/en/ | ||
Téléchargement | http://jp-minerals.org/vesta/en/download.html | ||
Remarque | Pour interfacer VESTA avec JANA, il faut, dans JANA, aller dans la rubrique "Tools / Programs / Graphics viewer" et définir le chemin d'accès de VESTA.exe. Il est également possible de procéder de la même manière pour "3d visualization of maps". |
Utilitaires
Compacteur 7-Zip | http://www.7-zip.org/ | ||
Editeur Notepad++ | http://notepad-plus-plus.org/fr/ |